A causa de su contrato en la serie 24, Michael no pudo unirse a sus colegas Richard Dean Anderson, Amanda Tapping y Ben Browder durante el rodaje en Ártico. Para explicar la ausencia de Daniel, Brad Wright creó un rebote enorme para el personaje.

Mientras que el SG-1 asiste a la ejecución de Baal, este último cambia el curso de los acontecimientos, dejando al equipo en una realidad donde el programa de la puerta de las estrellas no existe y en el cual Teal'c es el primado de Baal y Vala es la huésped de Quetesh así como reina de este último.

Intentando restablecer el curso de las cosas, los miembros del SG-1 toman caminos separados. Daniel no está en el Ártico porque perdió una pierna, un problema que quedará perpetuo a lo largo del telefilme. Esto le permitió a Michael explorar un aspecto más sombrío y más amargo de su personalidad. En cuanto este problema es resuelto (en cuanto las cosas regresaron a su curso normal), Daniel se vuelve más fuerte y seguro de si mismo al final de la película, preparado para una nueva aventura.

Basándose en sus memorias de infancia y de lo que le contó su abuelo, que perdió una pierna en el curso de la segunda guerra mundial, Michael se acuerda del número de veces que le observó y se dio cuenta de lo que era perder un miembro. También pasó un tiempo considerable en tratar de caminar con una sola pierna.

Michael Shanks habla también sobre Stargate The Ark of a Truth (con salida prevista en primavera del 2008) que concluye la trama Oris empezada en las temporadas 9 y 10 de Stargate SG 1. En este primer telefilme, Daniel es mucho más conflictivo de lo que hemos visto antes. Mientras que su idealismo legendario está intacto, Michael tiene la impresión de que Daniel está frustrado por el tema de The Pegasus Project (temporada 10, episodio 3). Compara a Daniel con un hombre que habla con Dios y le pide "¿por qué te quedas plantado sin hacer nada dejando el amor difundirse? "

Michael nos revela una última cosa, esta vez, se trata del último día de rodaje del último episodio de Stargate SG 1, "Unending" (temporada 10, episodio 20). Así como habían hecho en el momento de su primer día de rodaje, Michael, Amanda y Christopher se quedaron en la sala de control, rememorando todo lo que habían hecho. Luego cogieron algunos recuerdos. Michael revela que tiene en lo sucesivo el teléfono rojo del escritorio del general.

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